Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nell1Q2VWQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nell1Q2VWQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nell1Q2VWQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms