Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga4Q00651 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga4Q00651 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms