Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra1P97785 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra1P97785 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms