Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CgnP59242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CgnP59242 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CgnP59242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CgnP59242 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CgnP59242 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CgnP59242 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CgnP59242 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CgnP59242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CgnP59242 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CgnP59242 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CgnP59242 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CgnP59242 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CgnP59242 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CgnP59242 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CgnP59242 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CgnP59242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CgnP59242 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CgnP59242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CgnP59242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CgnP59242 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CgnP59242 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CgnP59242 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CgnP59242 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CgnP59242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CgnP59242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CgnP59242 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CgnP59242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CgnP59242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CgnP59242 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CgnP59242 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CgnP59242 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CgnP59242 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CgnP59242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CgnP59242 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CgnP59242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CgnP59242 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CgnP59242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CgnP59242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CgnP59242 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CgnP59242 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CgnP59242 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CgnP59242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CgnP59242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CgnP59242 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CgnP59242 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CgnP59242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CgnP59242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CgnP59242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CgnP59242 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CgnP59242 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CgnP59242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CgnP59242 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CgnP59242 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CgnP59242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CgnP59242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CgnP59242 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CgnP59242 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CgnP59242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms