Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AboP38649 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AboP38649 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AboP38649 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AboP38649 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AboP38649 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AboP38649 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AboP38649 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AboP38649 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AboP38649 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AboP38649 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AboP38649 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AboP38649 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AboP38649 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AboP38649 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AboP38649 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AboP38649 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AboP38649 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AboP38649 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AboP38649 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AboP38649 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AboP38649 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AboP38649 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AboP38649 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AboP38649 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AboP38649 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AboP38649 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AboP38649 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AboP38649 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AboP38649 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AboP38649 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AboP38649 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AboP38649 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AboP38649 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AboP38649 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AboP38649 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AboP38649 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AboP38649 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AboP38649 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AboP38649 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AboP38649 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
AboP38649 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AboP38649 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AboP38649 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AboP38649 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AboP38649 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AboP38649 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AboP38649 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AboP38649 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AboP38649 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AboP38649 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AboP38649 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AboP38649 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AboP38649 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AboP38649 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AboP38649 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AboP38649 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AboP38649 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AboP38649 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AboP38649 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AboP38649 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AboP38649 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AboP38649 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms