Protein–RNA interactions for Protein: P30681

Hmgb2, High mobility group protein B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb2P30681 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgb2P30681 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmgb2P30681 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmgb2P30681 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hmgb2P30681 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hmgb2P30681 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms