Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3P21107 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpm3P21107 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm3P21107 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms