Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme1P15532 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme1P15532 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme1P15532 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme1P15532 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme1P15532 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme1P15532 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme1P15532 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme1P15532 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme1P15532 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms