Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcrg-V1P06325 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcrg-V1P06325 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcrg-V1P06325 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcrg-V1P06325 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcrg-V1P06325 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcrg-V1P06325 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcrg-V1P06325 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcrg-V1P06325 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms