Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrygdP04342 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygdP04342 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.9 ms