Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn3O88990 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn3O88990 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn3O88990 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn3O88990 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn3O88990 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn3O88990 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn3O88990 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn3O88990 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn3O88990 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms