Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sema6bO54951 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sema6bO54951 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema6bO54951 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sema6bO54951 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema6bO54951 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.4 ms