Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd9O35177 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd9O35177 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nedd9O35177 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms