Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pot1bH7BX60 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pot1bH7BX60 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pot1bH7BX60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pot1bH7BX60 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pot1bH7BX60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pot1bH7BX60 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pot1bH7BX60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pot1bH7BX60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms