Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh9F8VPK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh9F8VPK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms