Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933403O08RikF6UK53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
4933403O08RikF6UK53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms