Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3hdm1E9Q9Q2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3hdm1E9Q9Q2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms