Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb3D3Z6J4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms