Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme3Q9WV85 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme3Q9WV85 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme3Q9WV85 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms