Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr54Q9R0D8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr54Q9R0D8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr54Q9R0D8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr54Q9R0D8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms