Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a3Q9QZS0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3Q9QZS0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms