Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabgef1Q9JM13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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