Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Bco1Q9JJS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Bco1Q9JJS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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Bco1Q9JJS6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Bco1Q9JJS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Bco1Q9JJS6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco1Q9JJS6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Bco1Q9JJS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Bco1Q9JJS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Bco1Q9JJS6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Bco1Q9JJS6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Bco1Q9JJS6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Bco1Q9JJS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Bco1Q9JJS6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Bco1Q9JJS6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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