Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RabggtaQ9JHK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtaQ9JHK4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RabggtaQ9JHK4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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