Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4aQ9ET37 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4aQ9ET37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4aQ9ET37 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc5a4aQ9ET37 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc5a4aQ9ET37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4aQ9ET37 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms