Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zcchc17Q9ESX4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zcchc17Q9ESX4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zcchc17Q9ESX4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms