Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall1Q9ER74 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sall1Q9ER74 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sall1Q9ER74 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall1Q9ER74 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall1Q9ER74 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms