Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift43Q9DA69 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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