Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc94Q9D6J3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc94Q9D6J3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms