Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf1Q9D2H9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf1Q9D2H9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf1Q9D2H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms