Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms