Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mms19Q9D071 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mms19Q9D071 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mms19Q9D071 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms