Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Exo5Q9CXP9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms