Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdcbp2Q99JZ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms