Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ApobrQ8VBT6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ApobrQ8VBT6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ApobrQ8VBT6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ApobrQ8VBT6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms