Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
0610009B22RikQ8R3W2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610009B22RikQ8R3W2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
0610009B22RikQ8R3W2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
0610009B22RikQ8R3W2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms