Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
McmbpQ8R3C0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
McmbpQ8R3C0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
McmbpQ8R3C0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms