Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn3Q8JZP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn3Q8JZP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn3Q8JZP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn3Q8JZP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn3Q8JZP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syn3Q8JZP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syn3Q8JZP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms