Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rsph6aQ8CDR2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rsph6aQ8CDR2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rsph6aQ8CDR2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rsph6aQ8CDR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsph6aQ8CDR2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsph6aQ8CDR2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms