Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb2Q8CC27 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb2Q8CC27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb2Q8CC27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms