Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cc2d1bQ8BRN9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cc2d1bQ8BRN9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms