Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo38Q8BMI0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fbxo38Q8BMI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo38Q8BMI0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms