Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrtm2Q8BGA3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrtm2Q8BGA3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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