Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnupnQ80W37 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SnupnQ80W37 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnupnQ80W37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnupnQ80W37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnupnQ80W37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 885.7 ms