Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec18aQ7TSQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clec18aQ7TSQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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