Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim17Q7TPM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim17Q7TPM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim17Q7TPM3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim17Q7TPM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms