Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Prrc2bQ7TPM1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Prrc2bQ7TPM1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Prrc2bQ7TPM1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prrc2bQ7TPM1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms