Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox11Q7M6Y2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox11Q7M6Y2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox11Q7M6Y2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms