Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd3Q6ZQK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ncapd3Q6ZQK0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ncapd3Q6ZQK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms