Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2aQ6P4T0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg2aQ6P4T0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg2aQ6P4T0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg2aQ6P4T0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms